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Study on Genetic Diversity of the Endangered Plant Abies ziyuanensis by Using Chloroplast SSR Marker
Author(s): DAI Wen-juan, TANG Shao-qing, LIU Yan-hua
Pages: 151-
155
Year: 2006
Issue:
2
Journal: GUANGXI SCIENCES
Keyword: 资源冷杉; 遗传变异; 叶绿体SSR;
Abstract: 用叶绿体微卫星(cpSSR)分子标记研究资源冷杉(Abies ziyuanensis)的遗传变异.资源冷杉分别取样于广西资源县和湖南城步县交界的银竹老山、湖南东安和新宁交界处的舜黄山、湖南炎陵县大院的7个居群.样品采用CTAB法进行总DNA的提取,用6对cpSSR引物进行扩增,扩增产物经95℃变性后在6%的变性聚丙烯酰胺凝胶上进行电泳,然后应用POPGEN Version 1.31软件计算资源冷杉各个居群的Nei's基因多样性指数(He),Shannon信息多样性指数(I),基因分化系数(Gst)以及Nei's遗传距离.用NTSYSpc Version 2.10软件进行UPGMA聚类分析,并对地理距离和遗传距离相关性进行Mental检验.用ARLEQUIN2.000软件分析地区间、居群间和居群内的遗传变异,统计有效单型模式数量.结果6对cpSSR引物中选出3对多态性引物,共扩增出7个位点.Nei's基因多样度He为0.2922,信息多样性指数I为0.4428,基因分化系数Gst为0.5805.资源冷杉的遗传分化主要存在于居群间,分布在银竹老山和舜黄山的资源冷杉与分布在大院的资源冷杉之间产生了明显的遗传分化,两地资源冷杉之间的遗传变异占总的68.87%.
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