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SNP Genotyping by Multiplex Amplification and Microarrays Assay and Forensic Application
Author(s): LI Li, LI Rongyu, LI Chengtao, LIU Yan, LIN Yuan, ZUO Tingzhi, SUN Meizuo, LI Yao
Pages: 90-
95
Year: 2005
Issue:
2
Journal: JOURNAL OF FORENSIC MEDICINE
Keyword: SNP; 基因型; 个体识别; 亲子鉴定;
Abstract: 目的对SNP基因分型芯片在个体识别中的应用价值进行研究.方法根据SNP不同等位基因的序列设计探针,制成分型芯片.采用4个复合PCR体系,用末端标记了Cy5的引物进行复合PCR扩增,产物与寡核苷酸探针进行杂交,根据杂交产生的荧光信号值确定样品在各SNP位点的基因型.将这一方法应用于109份样本的分型,根据基因型分布统计分析31个SNP位点的法医学应用价值.同时,进行家系调查和方法灵敏度分析.结果方法的灵敏度为1ng;所检测的31个SNP位点的累积个体识别率为0.9999999999979(偶合率为2.13×10-12),二联体亲子鉴定中累积非父排除率为0.9609,三联体亲子鉴定中累积非父排除率为0.997 0.家系调查的结果表明,这些位点等位基因由亲代向子代的传递符合孟德尔遗传定律.结论上述31个SNP位点为中高信息量位点,适用于法医学个体识别,可作为当前STR系统的补充.
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