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Mutation of hepatitis B virus detected by hybridization in oligonucleotide array
Author(s): 
Pages: 324-327
Year: Issue:  4
Journal: CHINESE JOURNAL OF MICROBIOLOGY AND IMMUNOLOGY

Keyword:  寡核苷酸芯片乙型肝炎病毒突变;
Abstract: 目的利用寡核苷酸芯片平行分析乙肝病毒表面抗原区S、前核心抗原pre-C区、X区、聚合酶P区12个已知的突变位点.方法针对S、pre-C、X、P区的12个突变位点,设计位于乙肝病毒反义链的24条寡核苷酸探针和两对PCR引物,探针长度为14~18bp,其5′端连有氨基己烷和T15间隔子,合成后经点样仪点到醛基化玻片上.两对PCR引物分别用于扩增S与P区内的5个突变位点和X、前C区内的7个突变位点,其中上游引物含有荧光标记.不对称PCR扩增所得到的荧光标记的单链DNA与寡核苷酸阵列杂交、清洗后经扫描分析实验结果.结果在对12个乙肝阳性样品前核心抗原C和X区的突变检测中,存在1762A→T,1764G→A联合突变的有2例、1896G→A突变的3例、同时存在1762A→T、1764G→A联合突变和1896G→A突变的1例、未存在任何突变的样品6例.在12个乙肝阳性样品的表面抗原S的突变检测中,未发现有突变出现.部分样品的随机测序结果与寡核苷酸阵列杂交结果一致.结论寡核苷酸芯片适于快速、平行、大量检测突变.
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