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VARIABILITY OF THE TERMINI OF SEOUL VIRUS S SEGMENT FROM NATURAL INFECTED RODENT HOSTS AND PATIENTS
Author(s): 
Pages: 35-41
Year: Issue:  1
Journal: Acta Parasitology et Medica Entomologica Sinica

Keyword:  Seoul virusTerminal sequenceVariantsQuasispeciesGenome deletions;
Abstract: 在汉城型汉坦病毒(Seoul virus,SEOV)长期感染的Vero-E6细胞过程中发现,病毒在持续感染过程中存在RNA3’末端序列缺失现象,可能对病毒的持续感染有重要作用.而自然感染的宿主动物或病人体内病毒RNA末端序列的变异情况并不清楚.本文从SEOV感染的病例血块以及SEOV检测阳性的褐家鼠肺组织中提取RNA,测定病毒S片段末端序列,并进行RNA二级结构模拟.结果发现,自然感染的宿主动物褐家鼠体内的SEOV S片段5’末端、3’末端及双末端均可出现序列缺失,而感染病例体内的病毒仅在一个克隆检测到3’末端序列缺失.与长期感染的Vero-E6细胞感染模型中仅存在较短的3’末端序列缺失现象不同,宿主动物的克隆既有较短的3’末端序列缺失,也有5’末端和双末端序列缺失,另外还有典型的大片段序列缺失.不同序列缺失类型的RNA序列二级结构模型存在显著差异.自然感染的宿主动物和病人体内的SEOV S片段序列末端存在序列缺失多样性,但前者的多样化程度更高.因此我们认为这些序列缺失可能受宿主因素影响,并与病毒对宿主的持续感染相关.
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