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Entropy Variation of the Human Ribosomal Protein Processed Pseudogenes During Evolution
Author(s): 
Pages: 647-653
Year: Issue:  6
Journal: JOURNAL OF INNER MONGOLIA UNIVERSITY(ACTA SCIENTIARUM NATURALIUM UNIVERSITATIS NEIMONGOL)

Keyword:  加工假基因紧邻碱基关联k-mer信息熵关联信息熵背景突变压力;
Abstract: 用生物信息学方法计算出人类核糖体蛋白加工假基因(RP加工假基因)的进化距离.假定在统计意义上,不同进化距离的假基因可粗略代表假基因的进化历程.在此假定基础上从信息论的角度去研究假基因在进化中的熵变.结果发现,1) 假基因序列的紧邻碱基关联随进化逐步增强;2) k-mer信息熵中,小k-mer(k=1,2,…,5)信息熵随进化减少,大k-mer(k=7,8)信息熵随进化先迅速减少,随后增加;3) 关联信息熵随进化减少,其中紧邻碱基关联信息熵的减少幅度最明显.这些可能与背景突变压力作用有关.
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