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Condition optimization and primer screening for ISSR-PCR of Demodex
Author(s): LIU Yan-rong1, LIU Fu-hong1, XIAO Ke-yuan1, GUO Shu-ling1, FENG Yu-xin2, YUAN Fang-shu1
Pages: 57-
61
Year: 2012
Issue:
1
Journal: Journal of Shandong University(Health Sciences)
Keyword: 螨; 微卫星重复; 反应体系优化; DNA引物;
Abstract: 目的以蠕形螨的DNA为模板,对蠕形螨简单重复序列锚定PCR(ISSR-PCR)反应体系优化并对ISSR引物进行筛选,为ISSR分析奠定基础。方法用自然沉降法收集山羊蠕形螨,用基因组DNA提取试剂盒提取山羊蠕形螨DNA,并以此为模板,以(CA)8RG(R为1分子的嘧啶)为引物,利用正交实验法,从Mg2+浓度、引物用量、dNTPs、DNA模板用量和TaqDNA聚合酶以及退火温度对蠕形螨ISSR-PCR反应体系进行优化,并以优化的反应体系筛选ISSR-PCR的引物。结果 ISSR-PCR 25μL最佳反应体系包括:0.4 mmol/L Mg2+、30 pmol引物、30~60 ng模板DNA、2u Taq酶,最佳退火温度为49℃、循环35次。筛选出10条条带清晰、多态性好、重复性高的引物。结论筛选出蠕形螨ISSR-PCR最佳反应体系和理想的引物,为蠕形螨的分子生物学研究奠定了基础。
Citations
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