Cloning and Characterization of Myocardial Ischemic Preconditioning Associated Gene five (MIP5) in the Rat
Author(s): WANG Jian-She, YUAN Can, WANG Kang-Kai, WANG Yao-Ling, LIU Mei-Dong, LIU Ke, XIAO Xian-Zhong
Pages: 185-188
Year: 2006 Issue: 3
Journal: CHINESE JOURNAL OF ARTERIOSCLEROSIS
Keyword: 病理学与病理生理学; 心肌缺血预适应; 电子克隆; 生物信息学; 基因; 心肌缺预适应相关基因5(MIP5);
Abstract: 目的采用生物信息学分析表达序列标签AW918640以获得其所代表基因的全长序列,并对该基因进行初步的特性分析.方法利用基因银行(GeneBank)数据库,通过BLAST比对等生物信息学方法进行电子克隆,采用逆转录聚合酶链反应和基因测序等技术进行鉴定,采用map viewer软件进行染色体定位,ExPASy和SMART软件对获得的全长基因进行翻译和蛋白质功能结构分析.结果 AW918640(基因银行登录号)为一个在大鼠心肌缺血预适应后3 h表达升高的表达序列标签序列,通过电子克隆得到其所代表基因的全长,且为一新基因,经逆转录取合酶链反应和基因测序证实后,将其命名为心肌缺血预适应相关基因5(MIP5),并在基因银行数据库上登录,登录号为AY553870.心肌缺血预适应相关基因5最大开放读码框为909 bp,编码302个氨基酸,含有6个kelch重复基序.结论心肌缺血预适应相关基因5为一与大鼠心肌缺血预适应相关的新基因.
Pages: 185-188
Year: 2006 Issue: 3
Journal: CHINESE JOURNAL OF ARTERIOSCLEROSIS
Keyword: 病理学与病理生理学; 心肌缺血预适应; 电子克隆; 生物信息学; 基因; 心肌缺预适应相关基因5(MIP5);
Abstract: 目的采用生物信息学分析表达序列标签AW918640以获得其所代表基因的全长序列,并对该基因进行初步的特性分析.方法利用基因银行(GeneBank)数据库,通过BLAST比对等生物信息学方法进行电子克隆,采用逆转录聚合酶链反应和基因测序等技术进行鉴定,采用map viewer软件进行染色体定位,ExPASy和SMART软件对获得的全长基因进行翻译和蛋白质功能结构分析.结果 AW918640(基因银行登录号)为一个在大鼠心肌缺血预适应后3 h表达升高的表达序列标签序列,通过电子克隆得到其所代表基因的全长,且为一新基因,经逆转录取合酶链反应和基因测序证实后,将其命名为心肌缺血预适应相关基因5(MIP5),并在基因银行数据库上登录,登录号为AY553870.心肌缺血预适应相关基因5最大开放读码框为909 bp,编码302个氨基酸,含有6个kelch重复基序.结论心肌缺血预适应相关基因5为一与大鼠心肌缺血预适应相关的新基因.
Citations
- The sequence of the human genome Venter JC Science
- Genome sequence of the Brown Norway rat yields insights into mammalian evolution Gibbs RA Nature
- cDNA微阵列结合聚类分析探讨大鼠心肌缺血-再灌诱导的基因表达谱改变 袁灿 中南大学学报(医学版)
- Preconditioning with ischemia:a delay of lethal cell injury in ischemic myocardium Murry CE Circulation
- Ischemic preconditioning:from the first to the second window of protection Pagliaro P Life Sciences
- 大鼠心肌缺血预适应诱导表达上调基因的筛选和鉴定 袁灿 生物化学与生物物理进展
- 用cDNA芯片检测大鼠心肌缺血预适应后基因表达谱的改变 吕青兰 中国动脉硬化杂志
- 用生物信息学方法克隆大鼠核不均一核蛋白A2/B1基因 张华莉 中国动脉硬化杂志
- Identification of Nd1,a novel murine kelch family protein,involved in stabilization of actin filaments Sasagawa K Journal of Biological Chemistry
- Novel Kelch-like protein,KLEIP,is involved in actin assembly at cell-cell contact sites of MDCK cells Hara T Molecular Biology of the Cell
- hDKIR,a human homologue of the Drosophila kelch protein,involved in a ring-like structure Mai A Experimental Cell Research
- Redox-regulated turnover of Nrf2 is determined by at least two separate protein domains,the redox-sensitive Neh2 degron and the redox-insensitive Neh6 degron McMahon M Journal of Biological Chemistry
- Protein Ser/Thr phosphatases with kelch-like repeat domains Kutuzov MA Cell Signal
- Isolation and characterization of IPP,a novel human gene encoding an actin-binding,kelch-like protein Kim IF Gene
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